DEEP版の追加要素
■追加要素
- 新たなダンジョン『嘆きの胎』が追加。
- 新たなエンディングが追加。（無印版の３ルートとDEEP版の３ルートで計６ルート分のエンディング）
- 新たな仲魔や装備品、サブアプリが追加。
- コマンダースキルが追加。コマンダースキルを持つサブアプリをセットすることで使用可能になる。
- フィールドセーブの追加。
- キャラクターボイスが付いた。
- 新たな人物「アレックス」の登場。
■追加された悪魔・アイテム・アプリの数
| 項目 | 追加数 |
| 仲魔 | 35体 |
| 武器：剣 | ５種 (無料DLC １種) |
| 武器：銃 | ７種 (無料DLC １種) |
| スーツ | ７種 (無料DLC ２種) |
| アクセサリ | ４種 |
| メインアプリ | １種 |
| サブアプリ | 19種 |
無印版からの変更点
■変更点
- 医療室の治療代が無料になった。福利厚生。
- サブアプリにサイズの概念がなくなった。そのため、ほぼ全てのサブアプリを同時に装着できる。
- 一部の剣や銃の攻撃力に調整が入った。
- 一部のデモニカスーツの防御力に調整が入った。また、ほぼすべてのスーツに破魔属性：無効が付いた。
- 一部の悪魔の属性相性が変更。
- ボス悪魔を仲魔にした際の所持スキルの変更。
- 敵の属性相性を視認できるサブアプリ「ギボアイズ」がデモニカの標準装備になった。
- 「見覚えの成長」を習得していなくても控えメンバーに戦闘経験値の一部が入るようになった。
- 狂神族の悪魔が誕生する可能性のある合体事故のレベル条件が変更。